Pain et Konan, membres d'Akatsuki, se lancent sur la piste de Jiraya qui s'est infiltré dans le village caché de la Pluie ! On apprend alors que le mystérieux Pain est en fait une vieille connaissance de Jiraya !Mais quel est donc le lien qui le rattache au vieux ninja de Konoha ?Et de quels effroyables pouvoirs ce dieu autoproclamé est-il doté ?